heres another weird situation.. I think this data set was made to be a rules challenger!!!<div><br></div><div><div>1079<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>270<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>1.1<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>23/07/1999<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>APH<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>AS<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>SPY<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                        </span>PREDATION:SPY HAD GRANT&#39;S GAZELLE INFANT,APH ASK FOR HELP TO GET KILL;YOY END UP WITH KILL<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                </span>P</div>
<div>1080<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>270<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>1.1<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>23/07/1999<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>APH<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>?<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>YOY<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>SUCC<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                                </span></div>
<div>1081<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>270<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>1.1<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>23/07/1999<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>YOY<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>+<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>APH<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                                        </span></div>
<div>1083<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>270<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>1.1<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>23/07/1999<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>APH,YOY<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>VS<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>SPY<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                                        </span></div>
<div><br></div><div>The issue is the last line having two actors... which is currently against the rules.   usually, these lines are AS lines, so I just split them into two.  It DOES seem as though a YOY AS SPY would be warranted.. if it weren&#39;t already implied by the YOY + APH.  We haven&#39;t been entering those AS&#39;s since they are redundant with the + line...  but what do I do with this VS business :-\</div>
<div><br></div><div>Lacey</div><br><div class="gmail_quote">On Tue, Dec 15, 2009 at 10:49 AM, Susan Alberts <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu">alberts@duke.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div class="im">On Dec 15, 2009, at 10:41 AM, Lacey Maryott Roerish wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
867     218     2.2     01/07/1999      LUI     AS      LOZ,LIZ                                 N<br>
<br>
I think the same thing goes here.  This is the whole MPI.  So it seems like we should (for both of these), just have these end up on two lines that have the same seqid  right?<br>
</blockquote>
<br></div>
This does not count as an MPI in my view. There is no third-party interaction. I think this is not an MPI.<br>
<br>
But in theory an MPI could begin like this. In this case again I think that we need to split this one line into two separate interactions.  Make sense?<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
S<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
Meaning that we change the rule to allow &#39;AS&#39; to have more than 1 actor or actee? I&#39;m not sure if Karl has built in a rule disallowing the first two lines of an interaction to both have act be AS. Karl?<br>
<br>
Thx<br>
Lacey<br>
<br>
On Tue, Dec 15, 2009 at 10:25 AM, Susan Alberts &lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu" target="_blank">alberts@duke.edu</a>&gt; wrote:<br>
Ok thanks. Do the rules allow two AS&#39;s to begin the interaction? If so, then we should have two AS&#39;s here. If not, then we probably need to change the rule. Also, it seems that we should change the seq = 1 rule we talked about before, so that two AS&#39;s in a row (as in this case) can have seq = 1. Does this make sense?<br>

S<br>
<br>
<br>
On Dec 15, 2009, at 9:32 AM, Lacey Maryott Roerish wrote:<br>
<br>
474     117     1.22    24/07/1999      DOX,VAT AS      VIA                                     N<br>
475     117     1.22    24/07/1999      VEI     +       VIA<br>
<br>
On Tue, Dec 15, 2009 at 9:13 AM, Susan Alberts &lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu" target="_blank">alberts@duke.edu</a>&gt; wrote:<br>
It looks to me like it should be two AS&#39;s.<br>
<br>
If you send me the whole MPI I might be able to comment more fully.<br>
<br>
S<br>
<br>
<br>
On Dec 15, 2009, at 9:08 AM, Lacey Maryott Roerish wrote:<br>
<br>
So I just came across an error regarding this error message.<br>
<br>
474     117     1.22    24/07/1999      DOX,VAT AS      VIA                                     N<br>
<br>
Should this be changed to a VS?<br>
<br>
L<br>
<br>
On Mon, Dec 14, 2009 at 9:20 PM, Susan Alberts &lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu" target="_blank">alberts@duke.edu</a>&gt; wrote:<br>
<br>
<br>
I think we want the original: &quot;two rows can&#39;t both have seq = 1<br>
unless they are both &quot;versus&quot; interactions&quot; unless you have<br>
some reason to want a change.<br>
<br>
Lacey and I have worked it out.<br>
<br>
OK<br>
<br>
<br>
S<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
Karl &lt;<a href="mailto:kop@meme.com" target="_blank">kop@meme.com</a>&gt;<br>
Free Software:  &quot;You don&#39;t pay back, you pay forward.&quot;<br>
            -- Robert A. Heinlein<br>
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<a href="mailto:Babase@www.eco.princeton.edu" target="_blank">Babase@www.eco.princeton.edu</a><br>
<a href="http://www.eco.princeton.edu/mailman/listinfo/babase" target="_blank">http://www.eco.princeton.edu/mailman/listinfo/babase</a><br>
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Susan Alberts, Dept of Biology, Duke University, Box 90338, Durham NC 27708. Phone 919-660-7272, FAX 919-660-7293<br>
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ph: 919-660-7306<br>
fax: 919-660-7293<br>
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