867<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>218<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>2.2<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>01/07/1999<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>LUI<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>AS<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>LOZ,LIZ<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                                        </span>N<div>
<br></div><div>I think the same thing goes here.  This is the whole MPI.  So it seems like we should (for both of these), just have these end up on two lines that have the same seqid  right?</div><div><br></div><div>Meaning that we change the rule to allow &#39;AS&#39; to have more than 1 actor or actee? I&#39;m not sure if Karl has built in a rule disallowing the first two lines of an interaction to both have act be AS. Karl?</div>
<div><br></div><div>Thx</div><div>Lacey</div><div><br><div class="gmail_quote">On Tue, Dec 15, 2009 at 10:25 AM, Susan Alberts <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu">alberts@duke.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div class="im">Ok thanks. Do the rules allow two AS&#39;s to begin the interaction? If so, then we should have two AS&#39;s here. If not, then we probably need to change the rule. Also, it seems that we should change the seq = 1 rule we talked about before, so that two AS&#39;s in a row (as in this case) can have seq = 1. Does this make sense?<br>
</div><font color="#888888">
S</font><div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
On Dec 15, 2009, at 9:32 AM, Lacey Maryott Roerish wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
474     117     1.22    24/07/1999      DOX,VAT AS      VIA                                     N<br>
475     117     1.22    24/07/1999      VEI     +       VIA                                     <br>
<br>
On Tue, Dec 15, 2009 at 9:13 AM, Susan Alberts &lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu" target="_blank">alberts@duke.edu</a>&gt; wrote:<br>
It looks to me like it should be two AS&#39;s.<br>
<br>
If you send me the whole MPI I might be able to comment more fully.<br>
<br>
S<br>
<br>
<br>
On Dec 15, 2009, at 9:08 AM, Lacey Maryott Roerish wrote:<br>
<br>
So I just came across an error regarding this error message.<br>
<br>
474     117     1.22    24/07/1999      DOX,VAT AS      VIA                                     N<br>
<br>
Should this be changed to a VS?<br>
<br>
L<br>
<br>
On Mon, Dec 14, 2009 at 9:20 PM, Susan Alberts &lt;<a href="mailto:alberts@duke.edu" target="_blank">alberts@duke.edu</a>&gt; wrote:<br>
<br>
<br>
I think we want the original: &quot;two rows can&#39;t both have seq = 1<br>
unless they are both &quot;versus&quot; interactions&quot; unless you have<br>
some reason to want a change.<br>
<br>
Lacey and I have worked it out.<br>
<br>
OK<br>
<br>
<br>
S<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
Karl &lt;<a href="mailto:kop@meme.com" target="_blank">kop@meme.com</a>&gt;<br>
Free Software:  &quot;You don&#39;t pay back, you pay forward.&quot;<br>
             -- Robert A. Heinlein<br>
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Babase mailing list<br>
<a href="mailto:Babase@www.eco.princeton.edu" target="_blank">Babase@www.eco.princeton.edu</a><br>
<a href="http://www.eco.princeton.edu/mailman/listinfo/babase" target="_blank">http://www.eco.princeton.edu/mailman/listinfo/babase</a><br>
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Susan Alberts, Dept of Biology, Duke University, Box 90338, Durham NC 27708. Phone 919-660-7272, FAX 919-660-7293<br>
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Babase mailing list<br>
<a href="mailto:Babase@www.eco.princeton.edu" target="_blank">Babase@www.eco.princeton.edu</a><br>
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- -<br>
Lacey K. Maryott Roerish<br>
Alberts Lab<br>
Department of Biology<br>
Duke University<br>
ph: 919-660-7306<br>
fax: 919-660-7293<br>
<a href="mailto:Lacey.Maryott@duke.edu" target="_blank">Lacey.Maryott@duke.edu</a><br>
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Susan Alberts, Dept of Biology, Duke University, Box 90338, Durham NC 27708. Phone 919-660-7272, FAX 919-660-7293<br>
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Alberts Lab<br>
Department of Biology<br>
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ph: 919-660-7306<br>
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